Mapowanie chromosomów

[Jakusz]

Chciałbym prosić o sprawdzenie mojego toku rozumowania, postaram się zadanie skrócić, bo pisanie wszystkich danych byłoby kłopotliwe i zadać pytania o rzeczy istotne

Wyniki jednej z krzyżówek heterozygot są następujące:

lBV 310
Lbv 290
lBv 125
LbV 115
lbV 73
LBv 67
LBV 11
lbv 9

Allelem środkowym jest L,
osobniki zrekombinowane podwójnie to LBV i lbv (bo jest ich najmniej)

Odległości między genami:
B-V=26 j.m. (125+115+9+11)/1000
L-B= 16 j.m. (67+73+9+11)/1000

Obliczyłem z ilości rekombinantów pojedynczych w zależności od tego czy zmiana względem genotypów rodzicielskich dotyczyła genu V, czy genu L. Czy dobry mam wynik?
Jeśli tak to reszta zdania jest analogiczna, tylko zagwozdka pojawiła mi się, gdy przy innym zestawie alleli u rodziców (tzn. inna ilość tych samych dominujących i recesywnych allei), ale z tym samym genem środkowym tj. L wyszła mi taka sama odległość.

[ Dodano: Sob Gru 13, 2008 13:54 ]
I pytanie pomocnicze. Czy w związku z mojazagwozdką mogę wysnuć wniosek, że przy tych samym rozkładzie liczbowym osobników które mają gen środkowy L (rzecz jasna w odniesieniu do przykładu całego zadania) odległości między genami zawsze będą takie same nie zależnie od pierwotnegoukładu alleli pod względem dominujące/recesywne?

Nie mam pewności czy wyrażam się do końca jasno:P

[dragonka]

Do obliczenia odległości między B-V musisz zliczyć wszystkie rekombinanty.
Jeśli chcesz mogę spróbować wyjaśnić dlaczego Ale myślę że sam do tego dojdziesz.

[Jakusz]

Do obliczenia odległości między B-V musisz zliczyć wszystkie rekombinanty.

No racja! W moje notatki z ćwiczeń wkradł się jakiś dziwny błąd, który namieszał mi zupełnie. Wynikało z tego coś bezsensownego jak się teraz okazuje.

[ Dodano: Sob Gru 13, 2008 17:11 ]
To jeszcze raz podaję wyniki:
B-L= (125+115+11+9)/1000= 26 j.m.
L-V= (73+67+11+9)/1000= 16 j.m.
B-V= 40 j.m.

Dobrze?

[malgosi35]

Wyniki jednej z krzyżówek heterozygot są następujące:

lBV 310
Lbv 290
lBv 125
LbV 115
lbV 73
LBv 67
LBV 11
lbv 9

masz rację że Ll jest środkowy, tu to widać po liczebności klas, zdarza się jednak że trudno jest wydedukować
odległość lB 73+67+11+9=160 16cM
odległość lV125+115+11+9=260 26cM
BV 125+115+73+67=380 tu doliczmy jeszcze2* (11+9) (podwójne)42cm
lub 16cm+26cm=42cM

[ Dodano: Nie Gru 14, 2008 21:44 ]

I pytanie pomocnicze. Czy w związku z mojazagwozdką mogę wysnuć wniosek, że przy tych samym rozkładzie liczbowym osobników które mają gen środkowy L (rzecz jasna w odniesieniu do przykładu całego zadania) odległości między genami zawsze będą takie same nie zależnie od pierwotnegoukładu alleli pod względem dominujące/recesywne?

Nie wiem czy o to chodzi ale dla genów lBV w innym zadaniu i z inną liczebnością wyszły ci takie same odległości?

To jest podstawą map chromosomowych: U danego gatunku, między danymi genami częstość crossing-over jest wartością stała.

[Jakusz]

odległość lB 73+67+11+9=160 16cM
odległość lV125+115+11+9=260 26cM

I tego nie rozumiem. tzn. nie rozumiem dlaczego bierzemy te wartości pod uwagę dla odległość lB i lV, a nie tak jak ja zrobiłem.

[dragonka]

Ustaw je sobie w kolejności BLV a nie w takiej jak tu jest, wtedy rozpisz rekombinanty w wyniku c-o pomiędzy B-L i L-V. Powinno wyjść. Jeśli nie to mogę Ci narysować jak ja to robię. Tylko się już nie gniewaj na mnie (pewnie już nie pamiętasz o co chodzi).

[malgosi35]

lBV 310
Lbv 290
lBv 125
LbV 115
lbV 73
LBv 67
LBV 11
lbv 9

Położenie genów jest takie w gametach głównych bez c-o (najliczniejsze)
bLv
BlV
Weżmy odległość BL-jeśli zajdzie crossing over to sprzężenie będzie wyglądać tak:

blV
BLv

czyli b jest sprzężone z L gdzie zostało rozerwane (c-o) tam gdzie b jest sprzężone z l lbV 73 lbv 9
oraz B z l czyli rozerwane w gametach gdzie jest BLLBv 67 , LBV 11

Ale zawile

[Jakusz]

Widzisz. ja sobie to rozpisuje w kolejności i dalej mi nic to nie daje. To musi być proste, ja wiem, ale nie mogę dostrzec, które wartości mam przypisać którym odległościom tj między B-L czy L-V, nie wiem którą odległość liczę, bo samo policzenie już nie sprawia problemu. Odległość B-V jest jasna.

[dragonka]

Ale rozumiem że nie chcesz zobaczyć mojego sposobu?

[Jakusz]

Aaa już rozumiem. Małgosiu dziękuje! Ja próbowałem znaleźć związek między gametami w liczbie 73 i 67 (jako że podobna liczebność) i na tej podstawie określać czy jest to odległość B-L czy L-V. A to trzeba spojrzeć na te z podwójną rekombinacją względem tej na którą patrzę wybranej z rekombinacji pojedynczej! Świetnie, to oznacza, że zdam jutrzejsze kolokwium

[malgosi35]

Patrz na geny. Jeśli w gamecie głównej jest sprzężenie bL to do liczenia bierzesz te grupy osobników u których nie ma razem bL tylko jest bl i na drugim chromosomie będzie sprzężenie Bl więc rekombinanty to te gdzie jest bl

[Jakusz]

Dragonka, dziękuję za pomoc, już doszedłem jak to ma być.

[malgosi35]

między gametami w liczbie 73 i 67

to się zgadza, one najczęściej mają podobną liczebność osobniki gdzie c-o zaszło w tym samym odcinku, tylko trzeba określić który to odcinek, patrzac na geny