Mikromacierze DNA - zastosowanie filtrów

[user]

Witam wszystkich.

Potrzebuję wsparcia w przetworzeniu danych z mikromacierzy.
Przetworzone dane potrzebne są w zastosowaniu sztucznych sieci neuronowych do predykcji przeżycia w przypadku pewnego nowotworu.

Mam bazę, plik z danymi o ekspresji wszystkich genów człowieka(54676 sond) w komórkach pewnego nowotworu od kilkuset chorych
Potrzebne jest zastosowanie filtra transkryptów niezmiennych oraz filtra transkryptów o niskiej ekspresji w celu odrzucenia ich w przygotowaniu danych. Próbowałem korzystać z narzędzie GenePattern, szczególnie GENE-E ale nie do końca wiem czego użyć żeby zastosować w/w filtry.

Proszę o pomoc.