Cześć wszystkim. Niedawno zaczęłam swoją przygodę z biochemią i mam problem z obliczeniem ładunku polipeptydu.
Mam takie zadanie:
Oblicz ładunek polipeptydu TEPIVADMEYGK w pH=7,0 i pH=12,0.
Wiem, że istnieją aminokwasy naładowane dodatnio (R,K,H) i ujemnie (D,E) w pH 7, oraz że koniec karboksylowy jest ujemnie naładowany, a koniec aminowy jest dodatnio naładowany w pH 7.
Wiem również, jak zachowuje się cysteina i tyrozyna (dzięki tabelce wartości pKa grup ulegających jonizacji).
Natomiast pozostałe aminokwasy mają ładunek równy zeru w polipeptydzie, gdyż nie mają grup bocznych, dobrze myślę?
Idąc tym tokiem myślenia wartości ładunków wyszły mi następujące:
pH = 7 : -2 (koniec N+1, Glu -1, Asp -1, Glu -1, Tyr 0, Lys +1, koniec C -1)
pH = 12 : -5 (koniec N 0, Glu -1, Asp -1, Glu -1, Tyr -1, Lys 0, koniec C -1)
Czy ktoś mi powie czy prawidłowo rozwiązałam to zadanie, czy może gdzieś popełniłam błąd i zechciałby mi to wyjaśnić?
Z góry dziękuję i pozdrawiam,
Karolina
obliczanie ładunku polipeptydu
Re: obliczanie ładunku polipeptydu
"Natomiast pozostałe aminokwasy mają ładunek równy zeru w polipeptydzie, gdyż nie mają grup bocznych, dobrze myślę? - pozostale aminokwasy maja grupy boczne, ale sa to grupy ktore nie maja ladunku
Przy tak malym peptydzie i dla pH 7 i 12 twoje zalozenie, ze ladunki beda akurat rowno plus lub minus jeden jest OK i otrzymalas poprawny wynik w zaokragleniu do zera miejsc po przecinku.
O wiele lepsza praktyka jest jednak liczenie konkretnych ladunkow za pomoca wzoru i konkretnych pKa. Tu jest dobry opis: isoelectric.ovh.org/theory.html
Przy tak malym peptydzie i dla pH 7 i 12 twoje zalozenie, ze ladunki beda akurat rowno plus lub minus jeden jest OK i otrzymalas poprawny wynik w zaokragleniu do zera miejsc po przecinku.
O wiele lepsza praktyka jest jednak liczenie konkretnych ladunkow za pomoca wzoru i konkretnych pKa. Tu jest dobry opis: isoelectric.ovh.org/theory.html
-
- Podobne tematy
- Odpowiedzi
- Odsłony
- Ostatni post
-
- 0 Odpowiedzi
- 6605 Odsłony
-
Ostatni post autor: Mejfiu
15 mar 2022, o 09:48
-
- 1 Odpowiedzi
- 860 Odsłony
-
Ostatni post autor: Adax82
4 kwie 2016, o 18:17
-
- 0 Odpowiedzi
- 1001 Odsłony
-
Ostatni post autor: gruda
15 gru 2014, o 10:19
-
- 2 Odpowiedzi
- 5264 Odsłony
-
Ostatni post autor: maxdobrowski
13 maja 2021, o 23:25
Kto jest online
Użytkownicy przeglądający to forum: Obecnie na forum nie ma żadnego zarejestrowanego użytkownika i 0 gości