Retrowirus?

Specjalistyczne forum biotechnologiczne. Metody biotechnologiczne: real-time PCR, western-blot, dot-blot, barwienie, chromatografia, dializa. Zakup, stosowanie odczynników: enzymy restrykcyjne, polimerazy DNA, drabinki i markery białkowe, kwasy nukleinowe, primery do sekwencjonowania, pożywki bakteryjne... Aparatura laboratoryjna, badawcza.
tchorz
Posty: 1120
Rejestracja: 12 paź 2009, o 17:53

Retrowirus?

Post autor: tchorz »

Czy każdy wirus RNA jest retrowirusem? a jeśli nie to dlaczego?
randomlogin
Posty: 3779
Rejestracja: 24 kwie 2010, o 12:11

Re: Retrowirus?

Post autor: randomlogin »

Nie. Pytanie dlaczego az prosi sie o odpowiedz bo nie, ale probujac skrotowo wyjsc poza to: retrowirusy to specyficzna grupa, ktora przepisuje material z RNA na DNA. Nie jest to niezbedne do funkcjonowania, bo przeciez RNA moze znakomicie funkcjonowac w miejsce DNA i jego komplementerna nic byc uzyta do syntezy bialka, badz tez w miejsce mRNA, i byc uzyte do tej syntezy bezposrednio.
tchorz
Posty: 1120
Rejestracja: 12 paź 2009, o 17:53

Re: Retrowirus?

Post autor: tchorz »

No właśnie jest taki standard licealny retrowirus to wirus RNA z odwrotną transkryptazą, która."
Zaczełam szukać czy odwrotnie to prawda, no i nie . Musi być ta odwrotna transkryptaza. samo RNA nie starczy
Usiłuję znależć jak może funkcjonować RNA? czyli to co napisałeś tylko wytłumaczone

No bo: Wirus DNA wbudowuje swój DNA do gospodarza
Retrowirus przepisuje RNA na DNA i wbudowuje w DNA gospodarza.
Tyle wiedza licealna

A tu okazuje się, że jest dziura w wiedzy bo jak to robią RNA? Jeśli jest to prościej to po co odwrotna transkryptaza? co to daje?
zna ktoś link?
randomlogin
Posty: 3779
Rejestracja: 24 kwie 2010, o 12:11

Re: Retrowirus?

Post autor: randomlogin »

Nie do konca rozumiem pytanie.

Normalnie DNA [etap 1] przepisywane jest na mRNAltskrot [etap 2], a nastepnie ono jest uzywane do sytentezy bialka [etap 3] - tak? W sensie - tyle wiedza maturalna obejmuje afair?

No i teraz RNA wirusa moze wskoczyc, w sensie zastapienia, w dwa miejsca:
a) w miejsce mRNA [etap 2], bo to nie jest jakies megaspecjalneinnenizwszystkieinne RNA - i dowolne wirusowe RNA o odpowiedniej sekwencji sie nada
b) w miejsce DNA [etap 1] - w koncu roznica miedzy RNA i DNA jakas zasadnicza nie jest - i dopiero posluzyc jako wzorzec do utworzenia (komplementarnego) RNA [etap 2], na podstawie ktorego zsyntetyzowane zostanie bialko
Do tego zreszta sprowadza sie podzial jednoniciowych RNA-wirusow.

No i istnieja retrowirusy - ktore maja RNA tak jakby w punkcie a), czyli na [etapie 2] - ale my przechowujemy swoje dane w DNA. Wiec zeby na stale zapisac w materiale danej komorki musza wykonac krok wstecz - do DNA z [etapu 1] i zintegrowac sie z DNA gospodarza. I wtedy dopiero na tej bazie tworzyc mRNA stanowiace [etap 2] i dalej bialka [etapu 3].

Sorry, linkow nie mam, i staram sie to opisac w miare jasno i na adekwatnym poziomie, ale pijany jestem, wiec musisz wybaczyc jesli mi nie wychodzi.
Awatar użytkownika
Medycyna Lwów
Posty: 5874
Rejestracja: 14 sty 2007, o 20:23

Re: Retrowirus?

Post autor: Medycyna Lwów »

ogólnie wirusy w wersji licealnej to jedno wielkie zakłamanie i uproszczenia, ale chyba jednak nie ma co wnikać na tym poziomie w nadmierne szczegóły.

TO co chcę podkreślić, to że wbudowywanie mat. genet. wirusa w DNA gospodarza to rzadkość wśród wirusów - ich mat. genet. się replikuję niezależnie od jądrowego DNA albo w jądrze albo w cytoplazmie. Więc nie uproszczajmy - tak robią wirusy lizogenne, których wielu nie ma.

Co do retrowirusów to mamy klasycznie wirusa HIV (RNA wirus lizogenny) i wirus HBV (bardzo nietypowy wirus DNA i tam nie pamiętam już dokladnie odwrotna transkryptaza działa jakby zataczając koło, szczegóły są na pewno w Wirusologii Colliera z tego co pamietam ale i w necie pogrzeb na tym konkretnym przykładzie).
tchorz
Posty: 1120
Rejestracja: 12 paź 2009, o 17:53

Re: Retrowirus?

Post autor: tchorz »

Ramdologin gdyby wszyscy nauczyciele byli nietrzeźwi i tak tłumaczyli
Kaamil dzięki
Niby do olimpiady obowiazuje na drugi etap materiał szkolny,ale jak się zacznie grzebać w szczegółach to.
echtsein
Posty: 12
Rejestracja: 19 wrz 2011, o 14:07

Re: Retrowirus?

Post autor: echtsein »

tchorz pisze:Czy każdy wirus RNA jest retrowirusem? a jeśli nie to dlaczego?
Nie nie jest. Retrowirusy są wirusami, które przy pomocy odwrotnej transkryptazy przepisują swój materiał genetyczny do DNA, a następnie przy pomocy innego wirusowego białka - integrazy wbudowują to DNA do genomu gospodarza. Ta integracja jest niezbędna dla replikacji wirusa. Oprócz retrowirusów istnieje cała masa innych wirusów RNA, których cykl replikacyjny nie obejmuje jednak integracji z genomem gospodarza.
Kaamil pisze:TO co chcę podkreślić, to że wbudowywanie mat. genet. wirusa w DNA gospodarza to rzadkość wśród wirusów - ich mat. genet. się replikuję niezależnie od jądrowego DNA albo w jądrze albo w cytoplazmie. Więc nie uproszczajmy - tak robią wirusy lizogenne, których wielu nie ma.
Uproszczeniem jest bezpośrednie przekładanie biologii bakteriofagów do wirusów eukariotycznych. Trudno też się zgodzić z tym, że wirusy integrujące to rzadkość, biorąc pod uwagę, że 8% całego genomu ludzkiego ma właśnie pochodzenie retrowirusowe, a pozostałe 34% retrotranspozonowe (elementy genetyczne wykazujące pewne cechy wirusów).
Awatar użytkownika
Medycyna Lwów
Posty: 5874
Rejestracja: 14 sty 2007, o 20:23

Re: Retrowirus?

Post autor: Medycyna Lwów »

to że są cechy domniemanych retrowiursów w naszym genomie i że miało to znaczenie ewolucyjne to co innego niż mówienie że jest dużo lizogenicznych CHOROBOTWÓRCZYCH u człowieka wirusów, bo te jako lekarz miałem na myśli przede wszystkim.
ODPOWIEDZ

Kto jest online

Użytkownicy przeglądający to forum: Obecnie na forum nie ma żadnego zarejestrowanego użytkownika i 0 gości