Jakie jest znaczenie splicing ma dla różnorodności białek ?!
Jakie są różnice w budowie białek aktywnych i nieaktywnych ?
splicing
Re: splicing
Geny eukariotyczne nie są ciągłe, sekwencje kodujące-egzony poprzerywane są sekwencjami niekodującymi- intronami a splicing polega na usunieciu tych intronów zagatha_89 pisze:Jakie jest znaczenie splicing ma dla różnorodności białek ?!
pierwotnego transkryptu i połączeniu ze sobą egzonów. Splicing może być alternatywny,
tzn. egzony mogą być łączone w dowolnej kolejności i niekoniecznie w mRNA musza
się znajdować wszystkie np. weźmy jakiś gen X w którego skład wchodzi 5 egzonów,
po alternatywnym splicinu kolejność tych egzonów może być taka:1-2-3-5, 1-3-4-5,
2-3-4-5, 1-3-5, kombinacji trochę jest i z jednego genu może powstać kilka rodzajów mRNA.
Kilka rodzajów mRNA to też kilka rodzajów białek, z regóły różniących się właściwościami ale ciągle z jednego genu.Na tym polega wpływ splicingu na różnorodność białek.
Oprócz splicingu na różnorodność białek wpływa też redagowanie mRNA(editing).
Żeby białko było aktywne musi zawierać wszystkie potrzebne domeny zapewniająceagatha_89 pisze:Jakie są różnice w budowie białek aktywnych i nieaktywnych ?
tą aktywność.Jeżeli którejś brak, białko nie ma swojej aktywności.
Tak samo dotyczy to skrócenia sekwencji białka na skutek mutacji w obrębie egzonu
(wstawiającej kodon STOP ) czego efektem jest brak możliwości przyjęcia prawidłowej konformacji cząsteczki białka umożliwiającej mu normalną aktywność.Tak samo na
aktywność białek mają wpływ mutacje zmiany sensu, w wyniku których zmienia się
struktura centrów aktywnych, domen i konformacji. Tak mi się przynajmniej wydaje.
Re: splicing
jakie to sa konkretnie domeny ?Mayr E pisze:Żeby białko było aktywne musi zawierać wszystkie potrzebne domeny zapewniające
tą aktywność.
Re: splicing
W każdym białku są inne. W dodatku w wyniku alternatywnego splicingu mogą powstać alternatywne domeny - skutkujące inną aktywnością białka
Re: splicing
Z enzymologii przykładów ci nie podam ale np. w kalmodulinie jest domena wiążąca Ca,agatha_89 pisze:Mayr E napisał/a:
Żeby białko było aktywne musi zawierać wszystkie potrzebne domeny zapewniające
tą aktywność.
jakie to sa konkretnie domeny ?
w czynnikach transkrypcyjnych są domeny odpowiedzialne za wiązanie się z DNA np.
motywy helisa-zwrot-helisa,palec cynkowy, suwak leucynowy,helisa-pętla-helisa,
bardziej znane homeodomena(HOX), słyszałem też o 70 aminokwasowej domenie śmierci która jest znacznikiem białek przeznaczonych do proteolizy w czasie chyba apoptozy.
Z definicji domeną nazywa się wyodrębniony fragment białka który potrafi utrzymać
strukturę trzeciorzędową niezależnie od reszty cząsteczki.Często domeny samoistnie
się zwijają (bez udziału chaperonów), i stanowią podstawowe części funkcjonalne w
cząsteczce białka.Niejednokrotnie te same domeny występują w różnych białkach z
powodu prawdopodobnie tasowania egzonów (W.Gilbert).
Kto jest online
Użytkownicy przeglądający to forum: Obecnie na forum nie ma żadnego zarejestrowanego użytkownika i 13 gości