Witam wszystkich.
Potrzebuję wsparcia w przetworzeniu danych z mikromacierzy.
Przetworzone dane potrzebne są w zastosowaniu sztucznych sieci neuronowych do predykcji przeżycia w przypadku pewnego nowotworu.
Mam bazę, plik z danymi o ekspresji wszystkich genów człowieka(54676 sond) w komórkach pewnego nowotworu od kilkuset chorych
Potrzebne jest zastosowanie filtra transkryptów niezmiennych oraz filtra transkryptów o niskiej ekspresji w celu odrzucenia ich w przygotowaniu danych. Próbowałem korzystać z narzędzie GenePattern, szczególnie GENE-E ale nie do końca wiem czego użyć żeby zastosować w/w filtry.
Proszę o pomoc.
Mikromacierze DNA - zastosowanie filtrów
-
- Podobne tematy
- Odpowiedzi
- Odsłony
- Ostatni post
-
-
mikromacierze DNA a inne metody diagnostyczne
autor: vasa_ » 30 maja 2015, o 17:00 » w Biotechnologia - 0 Odpowiedzi
- 10789 Odsłony
-
Ostatni post autor: vasa_
30 maja 2015, o 17:00
-
-
-
Praktyczne zastosowanie ziaren pyłku
autor: PascalUtp » 26 kwie 2015, o 19:33 » w Cytologia - biologia komórek - 1 Odpowiedzi
- 4147 Odsłony
-
Ostatni post autor: lepa98
16 maja 2015, o 12:51
-
-
-
nowe zastosowanie lampki jansjo
autor: jarud » 13 wrz 2016, o 16:00 » w Mikroskopia i mikrofotografia - dyskusje techniczne - 10 Odpowiedzi
- 15175 Odsłony
-
Ostatni post autor: jarud
15 wrz 2016, o 17:11
-
-
-
Utlenianie tlenku węgla tlenem z powietrza - zastosowanie
autor: Starfire » 17 sty 2015, o 15:58 » w Chemia nieorganiczna - 2 Odpowiedzi
- 4311 Odsłony
-
Ostatni post autor: Starfire
17 sty 2015, o 22:03
-
-
-
Mikroskop - nietypowe zastosowanie - techniczne - mikroskop przenośny
autor: DWSD » 28 lut 2020, o 10:54 » w Mikroskopy - 1 Odpowiedzi
- 4804 Odsłony
-
Ostatni post autor: jarud
28 lut 2020, o 20:51
-
Kto jest online
Użytkownicy przeglądający to forum: Obecnie na forum nie ma żadnego zarejestrowanego użytkownika i 0 gości