śmieci w DNA

[mennandore]

MAm pytanie a mianowicie w jednym genie są introny, które nic nie kodują . ale czy w DNA znajdują się pomiędzy genami takie sekwencje które także są niczym smieci, tzn nic nie kodują ? Oczywiscie gen traktuje jako fragment DNA który koduje jeden łańcuch polipeptydowy. I w tym jednym fragmencie sąsmieci (introny) i chodzi mi o to czy pomiędzy genami są też śmieci, tj sekwencje nukleotydów niekodujących ?

[_Marcin_]

Są, chodzi ci pewnie o tzw. junk DNA (DNA śmieciowy).Ale on nie do końca jest taki bezużyteczny, często mieszczą się w jego obrębie sekwencje regulatorowe np. enhancery i silencery a ponadto geny kodujące miRNA, które też ma niebagatelny wpływ na regulację ekspresji informacji genetycznej.Zresztą jak by te ogromne ilości DNA nie posiadały żadnej istotnej funkcji to by zostały wyeliminowane przez dobór naturalny, a tak nie jest.

[mennandore]

Tzn wiem ze napewno jakąś wartość mają chodziło mi wlasnie o kodowanie białek (jestem ignorantem lekkim - poziom szkoły średniej). Bo mówi się właśnie że tylko niewielka część genomu służy do kodowania białek. Czyli nie dość że pomiędzy genami są takieśmieci to jeszcze w samych genach też(introny) ?

[_Marcin_]

Bo mówi się właśnie że tylko niewielka część genomu służy do kodowania białek.

No zgadza się.

Czyli nie dość że pomiędzy genami są takieśmieci to jeszcze w samych genach też(introny) ?

Tak.Ponadto długość intronów jest znacznie większa niż egzonów w genie.

[malgosi35]

Ktoś mądry kiedyś powiedział, że człowiek zapisany jest w około 5%swojego genomu.
Więc tych śmieci trochę jest

[Jakusz]

Wskład śmieci wchodzą takżegeny skaczące tj. transpozony bedące wbudowanymi wirusami choć nieposiadającymi zdolnościskakania po genomie (tzn mają wyłączony enzym (transpozazę) do tego służący). Jeśli się nie mylę 70% naszego genomu to transpozony co w prostej linii mówi nam, że w 70% nasz genom jest pochodzenia obcego - wirusowego.

Pseudogeny - sekwencje posiadające cechy genów (promotory jednakże będące sekwencjami nieczynnymi lub niekodyjącymi lub po prostu nie eksprymowanymi w komórce. Mogą posiadać kodony stop w środku sekwencji, przesunięcia ramki odczytu itp.

[yeast]

Z tym, ze smieciowy DNA ma funkcje - po pierwsze geny nie musza kodowac bialek, czesto koduja RNA o funkcjach regulatorowych. Introny tez maja funkcje regulatorowe, do tego moga katalizowac reakcje wycinania samych siebie. Istnieja wspomniane juz sekwencje regulatorowe, promotory enhancery, silencery itp. Poza tym jest jeszcze funkcja strukturalna chromatyny, miejsca przyczepu wrzeciona kariokinetycznego, telomery, itd, itp. Tak naprawde nie nznamy jeszcze funkcji smieciowego DNA do konca, ale jest prawdopodobne, ze ma ono wazne funkcje. Niektore rejony smieciowe sa zreszta bardziej konserwowane niz geny.

[dragonka]

enhancery, silencery

Co to takiego?
Czy silencery mają cos wspólnego z interferencją DNA? (jedyne skojarzenie)

[yeast]

Silencer to przeciwińtwo enhancera.

[Savok]

Sa tosekwencje, z ktorymi wiaza sie czynniki transkrypcyjne zwiekszajac lub zmniejszajac poziom ekspresji genow