skąd się wzięły introny?

[sui]

mam pytanko tak z czystej ciekawości: czy introny powstały w transkrypcji? Czy po prostu w pewien sposób byłyzapisane w DNA i po prostu je wydzielono i tak nazwano? Ale gdyby tak było to chyba nie dałoby się odczytywać tak prosto aminokwasów mając nić matrycową. Troche pomieszałam, ale może zrozumiecie o co mi chodzi

[_Marcin_]

Troche pomieszałam, ale może zrozumiecie o co mi chodzi

No faktycznie, całkiem nieźle pomieszałaś i nie mogę się doszukać w tym jakiegoś sensu.
Istnieją dwie teorie tłumaczące pochodzenie intronów:teoria eksonowa i teoria insercyjna.
Pierwsza zakłada że przodek Procaryota i Eucaryota(LUCA) miał już geny nieciągłe a druga zakłada że LUCA miał/a geny ciągłe a introny pojawiły się w wyniku insercji u Eucaryota i Archaea.Można powiedzieć że są inwazyjnymi transpozonami mającymi zdolność wycinania się na poziomie RNA.
A jak było naprawdę, wydaje się że jednak LUCA miał/a geny nieciągłe, Procaryota a więc bakterie i sinice utraciły introny na skutek presji selekcyjnej na minimalizację zbędnej
informacji a Eucaryota zyskiwały dodatkowe introny poprzez insercje.

[sui]

Niezupełnie o to mi chodzi. Miałam na myśli skąd one się wzięły na mRNA. W książce z zadaniami maturalnymi miałam opisaną nić DNA jako egzony o jakiejś liczbie par zasad przerywane intronami też zbudowanymi z pewnej liczby zasad i potem introny były wycinane. Ale skoro to sa zasady, to czemu te zasady(opisujące introny) nie są oznaczone na nici matrycowej DNA, z której potem wnioskujemy budowę łańcucha białkowgo? Przecież gdyby były zasadami wycinanymi potem w obróbce potranskrypcyjnej, to można powiedzieć, że zostały wycięte dość spore odcinki nici matrycowej, więc nie można by było bezpośrednio(prawei bezpośrednio) z niej odczytać końcowego łańcucha peptydowego. Zasady azotwe to chyba zbyt znaczące fragmenty, żeby je pomijać. Więc informacja, że akurat w określonym miejscu w DNA ma być intron o określonej długości musi gdzieś być w tym DNA, tylko gdzie? I tu ostatnie pytanie z czego zbudowane są introny? Czy rzeczywiście z zasad azot.?

[Savok]

A z czego maja byc zbudowane? Z lipidow? Egzony i introny to sekwencje nukleotydowe o roznych funkcjach. Pierwsze maja funkcje informacyjna, drugie - regulatorowa. POneiwaz egzony i introny tworza nieprzerwany ciag DNA, polimeraza RNA zalezna od DNA nie moze sobie wybrac, co przepisze, a co nie. pre mRNA zawiera dokladna kopie DNA. Dopiero pozniej intorny sa wycinane aby utworzyc mRNA o sekwencji kodujacej bialko. Nieprawidlowe wyciecie intronow skutkuje powstaniem polipeptydu o innej sekwencji aminokwasowej niz zamierzona.

Introny sa oznaczone odpowiednimi sekwencjami na ich poczatku i koncu, dzieki czemu enzymy uczestniczace w splicingu wycinaja odpowiedni fragment pre mRNA.

[Jakusz]

Ja do końca nie wiem o co Ci chodzi sui. To egzony są kolejnymi trójkami nukleotydów kodującymi polipeptyd - nie introny. Zatem odczytanie przez nasciągiem sekwencji polipeptydu jest możliwe jedynie z dojrzałego mRNA bez intronów. Z DNA bezpośrednio tego zrobić się nie da.

[_Marcin_]

To egzony są kolejnymi trójkami nukleotydów kodującymi polipeptyd - nie introny.

W intronach(nie wiem czy we wszystkich, ale na pewno części grup I i II) są otwarte ramki odczytu dla specyficznych endonukleaz i enzymów o właściwościach odwrotnych transkryptaz, które uczestniczą w ich transpozycji.Więc introny też mogą kodować polipeptydy.

[dragonka]

Mój nauczyciel opowiadał mi ostatnio o intronach i wspominał nazwę pewnych enzymów które je wycinają. Może ktos wie coś więcej na ich temat? Czym są? (czy to rodzaj RNA?)
Co mogą kodować introny? (bo podobno kodują, u niektórych organizmów- muszka owocowa?)
Poza tym wspominał jeszcze, że introny to takiśmietnik genomu", jesli mozna to tak nazwać. Pozostałość po przodkach. Według niego ekspresja informacji zawartej w intronach powoduje powrót takich cech jak sierść czy łuska, powodujących różne choroby człowieka. Czy to możliwe?

[_Marcin_]

O innych produktach translacji czy transkrypcji dla których informacja zakodowana jest w sekwencji intronu, poza wcześniej wymienionymi nie słyszałem(nie szukałem też nigdy, jakoś mnie to nie interesowało).

[dragonka]

Nie mogę niestety tego otworzyć. Nadal czekam na jakies wyjaśnienie bądź wskazówkę.

[yeast]

wspominał nazwę pewnych enzymów które je wycinają

Ogólnie kompleks białek i RNA biorących udział w plicingu nazywa się jakżeż oryginalnie spliceosomem. Generalnie wycinanie intronów zachodzi autokatalitycznie, białka z tego co pamiętam były potrzebne do zapewnienia odpowidniego ułożenia, ochrony itp.